Quản lý chất lượng nông lâm sản và thủy sản có nhiệm vụ quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm đối với:
- Sơ chế, chế biến sản phẩm chăn nuôi, trồng trọt;
- Cơ sở thu gom, bảo quản, sơ chế, chế biến, kinh doanh, xuất khẩu thủy sản;
- Kiểm tra an toàn thực phẩm đối với thủy sản xuất khẩu;
- Cơ sở sản xuất nhiều loại sản phẩm thuộc phạm vi quản lý